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gff2gtf

2022-03-14  本文已影响0人  Lou_5df0

1.试了gffread,失败,只能转换mRNA的gff文件,局限性太大了。
2.试了R包的rtracklayer,也不行,放弃了。
3.最终使用agat的agat_convert_sp_gff2gtf.pl,解决了。
4.https://github.com/NBISweden/GAAS/blob/master/annotation/knowledge/gff_to_gtf.md gff2gtf工具的大汇总和比较,这里贴一下。

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