学习小组Day5笔记--LA

R语言的操作

1.R语言的操作前提知识

• 1.R语言赋值，a <-
• 2.Console是输入命令的控制台
• 3.R语言命令中数据都在是带括号的，为了区分包括[]、()等
• 4.向量是由元素组成的可以是元素也可以是字符串
• 5.表格叫数据框
• 6.要学会搜索命令函数的意思，？+命令（加号几个省略掉）
• 7.数据类型重要的是向量和数据框

2.操作

• 1元素是数字和字符串（用chr表示） 1
  2
• 2提取元素
  根据元素的位置

#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

根据元素的值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

• 3 数据框
  读取本地数据

read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t".header =T)
赋值a <-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t".header =T)

设置行号和列号

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） 

加载变量

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

总结

整篇文章大多都引自生信星球中的课程，真的很棒哦！学了很多。

总结