论孟德尔随机化与单细胞联合研究的可能性

因为我自己研究的领域跨单细胞、QTL、以及孟德尔随机化，所以就一直在思考这个问题：单细胞能不能和孟德尔随机化联合起来研究？

这方面的文章或者研究比较少。两个组学能够联合我能想到的最大的可能性是基因或者细胞，单细胞具备了这两个维度，但是孟德尔随机化本身只是个方法、工具，能拿来的最大可能是QTL，这个技术本身是研究基因、蛋白或者甲基化等内容的，所以最大的可能性是基因，通过基因来跨两个领域。

比如说eQTL或者pQTL研究完后，通过看看基因在疾病表达情况、确定其表达的主要细胞，这也是个简单的应用。sc-eQTLGen已经做过这个事情了，数据库就在https://eqtlgen.org/sc/datasets/1m-scbloodnl-dataset.html。数据也是公开的，都可以下载，数据量也很大。

在该研究中，研究者对荷兰北部人群队列的120个人进行了单细胞RNA测序。每个外周血单个核细胞(PBMC)在未刺激的条件下进行测序，在体外用白色假单胞菌(CA)、结核分枝杆菌(MTB)和铜绿假单胞菌(PA)刺激3小时和24小时后，共约130万个细胞。

可以看到数据量是很大的，130万个细胞，想分析估计得上好点的服务器。发的几篇文章也可以学习一下，基本上如果你能做到联合分析，得到有意思的结论，可以说文章是很好发表的。

其他结合的可能性只有读文献甚至要对两个领域很熟悉继续摸索了，比如说细胞比例-QTL-疾病。

随口说一句，有时候并不是纯生信杂志不收，实在是那些lan套路文章编辑看了恶心，大家还是要摆脱桎梏。