取子集
2023-05-29 本文已影响0人
oceanandshore
[section 1] step03-提取单细胞亚群子集_哔哩哔哩_bilibili 2分钟开始
R里面取子集可以根据，逻辑值 或者 是坐标 取。
逻辑值 是判断要不要取，坐标是告诉他取哪个坐标
cd4_sce1 = sec [,sce@metadata$seurat_clusters %in% c(0,2)] # 逻辑值
cd4_sce2 = sec [, Idents(sce) %in% c("Naive CD4T","Memory CD4T")] # 和上面的效果一样
# subset 函数也可以
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