单细胞SRR数据拆分
2021-11-10 本文已影响0人
Zee_李海海
10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq
fastq-dump SRA转fastq
#10x SRR需要加--split-file和--include-technical参数
fasterq-dump -O ./ --split-files -e 40 ./SRR7722937 --include-technical
ls -lh
参考链接:
10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq踩坑那些事
fasterq快速转换sra文件到fastq测序数据
单细胞实战(二) cell ranger使用前注意事项