多样性格局与保护

批量下载GenBank基因序列数据(指定物种、指定基因)

2021-05-26  本文已影响0人  雨林课堂

工具: Biopython

# from Bio import Entrez #加载包

# from Bio import SeqIO  #加载包

个人联系邮箱:

Entrez.email = "example@qq.com" # your email

Entrez.api_key = "xxxxxxxxxxxxxxxxxxxx" #个人NCBI API key

功能:批量下载指定物种的基因片段序列,可筛选非短片段的叶绿体基因组序列。

需要提供的信息:“Gene name”,物种名单(拉丁名),每个物种下载的基因片段的数量(可下载该物种的全部序列)

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