批量下载GenBank基因序列数据(指定物种、指定基因)
2021-05-26 本文已影响0人
雨林课堂
工具: Biopython
# from Bio import Entrez #加载包
# from Bio import SeqIO #加载包
个人联系邮箱:
Entrez.email = "example@qq.com" # your email
Entrez.api_key = "xxxxxxxxxxxxxxxxxxxx" #个人NCBI API key
功能:批量下载指定物种的基因片段序列,可筛选非短片段的叶绿体基因组序列。
需要提供的信息:“Gene name”,物种名单(拉丁名),每个物种下载的基因片段的数量(可下载该物种的全部序列)