【ChIP-seq】资源汇总
2018-10-01 本文已影响20人
caokai001
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表观遗传小白逆袭之道：从这 19 个视频开始吧！
本系列视频涵盖表观遗传相关的细分领域：3D 基因组、DNA 甲基化及其动态调控、增强子调控、非编码 RNA（包括 miRNA、环形 RNA 等）、DNA 6mA 修饰、RNA 修饰、染色质修饰与可变剪接，生物信息学分析（ChIP-Seq & RNA-Seq），以及表观基因组学常用的方法学和数据库/网站（ENCODE & Roadmap）介绍等。
为了进一步方便小伙伴们检索和观看，现将这 19 个视频梳理如下（点击相应图片即可直接进入相应的视频页面）：
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哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？怎样筛选？基于分析或实验的可行方案V2.1
ChIP-seq不画出这样的结果图，哪好意思说自己是做生信的
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ATAC-Seq入门加高阶传送门（点击进入交流群）
第1篇：ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同
第4篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（一）——phantompeakqualtools
第5篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（二）——ChIPQC
第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化
第10篇：ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析（本系列完结，内附目录）
