统计某列标签的重复个数

1.awk：

example.txt

awk -F '\t' '{sum[$1]++}END{for(i in sum) print i "\t" sum[i]}' example.txt

result

ref：awk常用命令---统计某一列标签个数 - tianyunzqs的专栏 - CSDN博客

2.sort|uniq

awk '{print $5}' sample1-1.bowtie2.charrna.sam | sort | uniq -c | sort -nk 2

统计MAPQ