空间转录组课表
2023-09-07 本文已影响0人
单细胞空间交响乐
经过上次课，发现大多数人还是需要带着跑一跑代码和讲解代码分析过程的注意事项，吸取上次的教训，空转课表，对课程进行细化，带大家分析空间转录组和分析代码，以及代码过程中的注意事项，感谢大家的支持：
空间基础处理（Seurat）
空间多样本联合分析（Seurat）
空间基础处理（scanpy）
单细胞空间联合分析（Seurat）
单细胞空间联合分析（cell2location）
单细胞空间联合分析（RCTD）
单细胞空间联合分析（MIA）
空间转录组通讯分析（stlearn）
空间转录组通讯分析（COMMOT）
空间转录组轨迹分析（SPATA2）
空间转录组CNV分析（SPATA2、siCNV）
空间转录组富集分析（GSVA、包括marker的富集打分）
空间转录组高级绘图（细胞共定位、饼图、空间密度图）
空间转录组高级绘图（细胞类型方向图、区域细胞密度气泡图）
空间转录组绘图（配受体空间分布、配受体共定位、细胞定位近邻热图）
空间转录组细胞聚类
空间转录组细胞共定位
空间转录组细胞网络（cell degree）
空间轨迹（SPATA2）
空间基因开关
空间轨迹向量场
空间WGCNA（WGCNA）
空间文章复现（心脏）
空转文章复现（肝癌）
空间文章复现（心肌）
。。。。。（后续根据需求再补充）
这次吸取教训，不能放这么多人进群了，每节课100块，进群200块，进群后我先把第一节课的脚本和示例数据发给大家，跟华哥一样有20个人听课就可以了，这次支持报账，大家有需求，可以加我微信，非诚勿扰，单细胞全系列课程的视频，脚本和示例数据有需要的也可以联系，目的就是吸收学员，而不是喷子 ，下面是链接。
https://mp.weixin.qq.com/s/h0j5jlvDjW09Pr7FuKk8Aw
生活很好，有你更好
