基因流检测软件Dsuite安装教程

Dsuite软件的网站在Github上，
GitHub - millanek/Dsuite: Fast calculation of Patterson's D (ABBA-BABA) and the f4-ratio statistics across many populations/species
这是一个检测基因流的软件，非常经典、非常好用！
但是安装如果没有root权限还是有一点复杂的
第一步就是去Github里面把源码下载下来，
按照教程进入文件夹直接make应该就可以了，但是没有root权限最大的问题就是无法更新gcc，因此我们使用mamba来更新

# 安装gcc
mamba install gcc=11.2.0
# 安装g++
mamba install -c moussi gxx_impl_linux-64

安装完以后，用which x86_64-conda_cos6-linux-gnu-g++找到g++的位置，

ln -s ~/mambaforge-pypy3/bin/x86_64-conda_cos6-linux-gnu-g++ ~/mambaforge-pypy3/bin/g++

软连接一下，就可以继续make了，然后报错fatal error: zlib.h: No such file or directory，因为我们没有更新zlib.h，同样用mamba来安装，

mamba install -c anaconda zlib

之后，用find /public/home/Wanggs/mambaforge-pypy3 -name zlib.h找到zlib.h的位置，并将该位置加入Dsuite文件夹中的Makefile文件中，

CXXFLAGS=-std=c++11 -I/public/home/Wanggs/mambaforge-pypy3/pkgs/zlib-1.2.13-hd590300_5/include

接着make就没什么问题了

按照流程下一步就是

cd utils
python3 setup.py install --user --prefix=

但是我们发现pandas非常难安装，我们还是使用mamba

mamba install pandas

安装好以后，再次运行

python3 setup.py install --user --prefix=

成功！