Day6 陈海影
学习R包
安装加载R包三部曲
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 镜像
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
install.packages("dplyr")安装或bioconductor::install()
library(dplyr)加载
dplyr五个基础函数
1.mutate(),新增列
mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)
2.select(),按列筛选
select(test,Sepal.Length)
select(test,1)
select(test,c(1,5))
3.filter()筛选行 即按条件筛选出所需
filter(test, Species == "setosa")
filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 4.arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序(默认从小到大)
arrange(test, desc(Sepal.Length))#用desc从大到小
arrange(test, Sepal.Length, desc(Sepal.Width))
5.summarise():汇总
summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))# 计算Sepal.Length的平均值和标准差
先按照Species分组,计算每组Sepal.Length的平均值和标准差
group_by(test, Species)
summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))
dplyr两个实用技能
1:管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)
2:count统计某列的unique值
count(test,Species)
dplyr处理关系数据
1.內连inner_join,取交集
2.左连left_join
3.全连full_join
4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
6.简单合并cbind