热图不实用技巧

其实excel就能做出来一张热图，例如下面这样。

你甚至能定制化很多有意思的地方，比如这张图就实现了所谓的三列column name。第一列标注基因ID，第二列是基因名，第三列是功能性描述。
具体做法就不讲了，因为你在TBtools、originlab、prim8甚至R里同样可以快速实现相同的功能。而excel里想要实现聚类，极坐标转换等操作相对麻烦。
用TBtools举例：

你只需要输入数据，点击确定。然后选中log2压缩数据，一张基本的热图就做好了。
在这里很多人会问这个log2什么意思，还有人说自己的基因表达量是负值，为什么选中这个就变成从0开始了……基因负值说明你做了些奇怪的标准化。毕竟从基因表达量和相对表达量只有表达高和低甚至不表达……例如RNA-seq用counts计数（或者TPM），qPCR用relative expression，怎么都不会有负值出现存在的。而这里的log scale的意思就是给你的数据取对数。结合下面base=2和logwith=1不难理解：
变换后的数据 = ，其中x > -1
函数图像如下

这样做的好处是整个图像过(0, 0)点。扯远了……数据取对数

然后更改宽度

差不多就能得到一张类似的图形了

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但是TBtools如何实现三列column name的操作呢？这个就是今天我想尝试的事情。首先最简单的办法就是在每个名字后面手动加入一定量的空格，比如下面这个图片的样子。

然后作图

感觉并不是很理想，三列并没有对齐。那么有什么改进的办法呢？我们可以尝试加入不一样多数量的空格，通过excel的函数功能我们可以轻松的实现这一功能。

其中用到了两个函数

=LEFT($B$4,35-LEN(B5))
=B5&C5&D5&E5&F5

第一个函数是根据前一列的长度给这个单元格赋予一定数量的空格。其中表格B4里存入大量的空格，len()负责计算前一个单元格的字符长度，注意35这个数值应当大于前一个单元格的最大长度。
后一个函数把所有字符合起来。其实可以写的更干净的，这里方便理解就摊开一点。
好了右边的名字看起来比之前加入固定空格数要好看不少了。但是还是不齐，这主要是因为有些符号虽然占了1个字符字节数但是并没有占用1个字符宽度。如果你的基因ID一致，那么此时应该就没有任何问题。

如果你的数据ID不是很一致呢？比如你的gene ID有很多奇怪的符号，此时你就需要一些特别的姿势了。
最简单的方法就是你把图片另存为svg格式，然后用矢量图编辑软件编辑。这里不推荐AI之类的，因为是商用的收费软件，如果你使用盗版，这些公司会给你发律师函。如果你有钱可以试试affinity designer（之前最低的时候不到200），而如果不想花这个钱不妨试试inkscape。这里顺便推荐一下专注于科研作图的up主。
https://www.bilibili.com/video/BV1Hp4y1S768
参考他的教程你也能轻松编辑矢量图文件。

如果你还是觉得麻烦，我推荐你试试powerpoint。
是的powepoint也能编辑svg文件。可能多数时候大家更倾向于保存为300 dpi的png或者jpeg，但保存为svg矢量图才会让你的图片有更大的后期编辑空间。只要你的ppt版本支持矢量图导入（我买的office 365），我强烈推荐你导入矢量图。
接下来只需要将图片转换为形状

再取消分组

你的热图就变成了一个一个的小组件了！

接下来的操作我想大概人人都会吧。毕竟教ppt使用技巧的太多了！
折腾完了另存为图片
image.png

然后另存为svg就好了

接下来怎么折腾都随便你了。说个题外话，TBtools导出的svg是相当规范的。像originlab导出的格式会默认把所有文字变成图形符号，而ppt导出的svg的文字框经常乱飘……后期二次、三次编辑会非常麻烦。
最后分享一个彩蛋，其实三列column name在TBtools中也能实现。但是在作者没有强化编辑图层功能和优化图形操作前，这个功能是没有意义的。