NBIS系列单细胞转录组数据分析实战汇总

2021-04-08 本文已影响0人 Davey1220

Single cell RNA-seq analysis workshop

该系列课程由瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 负责设置，为瑞典Phd学生，博士后，研究人员和瑞典学术界的其他工作人员开设的全国性研讨会。

本课程将通过演讲和实战练习涵盖了单细胞转录组（scRNA-seq）数据分析的基本步骤。涵盖的主题包括：

An overview of the current scRNAseq technologies（当前常用scRNA-seq技术概述）
Basic overview of pipelines for processing raw reads into expression values（原始测序数据比对转换为基因表达矩阵的分析流程概述）
Quality control of scRNAseq data（scRNA-seq数据的质量控制）
Dimensionality reduction and clustering techniques（数据降维和聚类分析技术）
Data normalization（数据归一化处理）
Differential gene expression for scRNAseq data（scRNA-seq数据的差异基因表达分析）
Celltype prediction（细胞类型预测）
Trajectory analysis（细胞轨迹拟时分析）
Comparison of different analysis pipelines such as Seurat, Scran and Scanpy（不同分析工具流程的比较，如Seurat，Scran和Scanpy）

image.jpg