pandas 之test1：对表格进行过滤P值和FC值

1、文件：附件3_蛋白质定量和差异分析列表.xlsx

image.png
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2、目的:
通过P值和FC的过滤，生成样本表达矩阵；

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3、脚本：

import pandas as pd
import numpy as np
import re

file3 = u"附件3_蛋白质定量和差异分析列表.xlsx"
out = "out.csv"

df = pd.read_excel(file3, sheet_name=u"B VS D显著性差异分析")
df1 = df[(df.iloc[:, -1] < 0.05) & ((df.iloc[:, -2] > 1) | (df.iloc[:, -2] < -1))].iloc[:, np.r_[1, 5:17]]
#print(df1.columns)
df1.columns = df1.columns.str.replace(".raw.PG.Quantity", "")
df1.columns = [re.sub("\[\d+\]","",v) for v in df1.columns]  ##df1.columns是个数组
df1.to_csv(out, sep=",", index=False)