测序芯片理解 2020-05-05

• 电脑芯片和测序芯片是两回事
• 测序仪的芯片应该叫做流动室，paper里常称为flow cell，是供试剂和核酸流动的物理空间，属于纳米级别的密集孔径矩阵，没有其它电路元器件，BGI的孔径有220nm规格的，只供单个DNB进入
• 常见的NGS都是流动室的
• 芯片两端各有一个开口，一进一出
• 所有的试剂都是从相同的口进去
• 芯片的使用寿命都是一次性，通过高的通量来控制成本
• 每个碱基反应完后拍照，要把剩余的洗掉才能进行下一个碱基的聚合反应
• 聚合反应是在溶液环境，溶液中残留很多的底物会影响拍照
• 一个进口一个出口是避免试剂交叉污染，没法准确测序

常称为生物芯片，区别于电子芯片