DNA甲基化RGEO数据挖掘

[R]甲基化③来自R包ChAMP维护者的ChAMP学习资料(Ch

2019-06-24  本文已影响21人  郑宝童

1.甲基化①ChAMP帮助文档译[上]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline)
2.甲基化②ChAMP帮助文档译[下]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline)

我之前翻译了ChAMP的帮助文档,发觉看起来并不够直观。而且由于翻译水平有限,有些用语并不够准确,很容易让看得人蒙圈。于是乎,我继续上网搜索ChAMP的学习材料。哈,在CSDN博客网站发现了ChAMP维护者的一篇博文,该博文更加白话的阐述了ChAMP的是使用细节,具有比较强的可读性。作者对ChAMP做了shiny实现,你可以直接通过点点鼠标来跑这套流程。

重要的链接粘三遍!!!

该文从1. 摘要、2. ChAMP包说明、3. 程序运行展示、4. 总结 这四个方面进行阐述。下方是Smart TOC插件自动生成的目录。

image.png

分隔线:上方是ChAMP 维护者的博文链接,下方是我自学甲基化时,常看的公众号


事实上我刚接触甲基化的学习不久,最开始学习的是“计算表观遗传学”公众号的资料。

计算表观遗传学

公众号简介:该公众号是由张岩老师课题组运营的,张老师组表观实力很强,所提供的甲基化学习资料是目前我阅读的最好的,最成体系的甲基化资料之一。

甲基化部分主要是以下六讲,下方给出目录,完整版请关注 计算表观遗传学。

甲基化

“计算表观遗传”公众号中,也有一篇关于ChAMP的文章:“集识别差异甲基化和拷贝数变异于一体的R包——ChAMP”,你也可以去搜索一下下。当然,想获取更多甲基化知识点,记得关注“计算表观遗传学”公众号

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