一. 向量

• 向量，元素，标量区别
  图引自生信星球
  image.png
• 赋值
  给变量定义就是赋值, 注意以最后一次为准！注意以下常用表达
  x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
  x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
  x<-seq(1,10,by = 0.5)#1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号）
  x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
• 从向量中提取元素
  1.根据元素位置
  这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
  x[4] #x第4个元素
  x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
  x[2:4]#第2到4个元素
  x[-(2:4)]#除了……
  x[c(1,5)]#第1个和第5个元素
  2.根据值的大小
  x[x==10]#等于10的元素
  x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

二. 数据框

• 练习时先将doudou.txt和huahua.txt数据放在RData文件夹下
• 读取本地数据
  read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件，分隔符为Tab(点tab键可以出来seq)，有表头
  a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a
• 设置行名和列名
  X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
  colnames(X) #查看列名
  rownames(X)#查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
  colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
  X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
  撤销吗: 用刚才的read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖了."变"量看最后一次！）
• 数据框的导出
  write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#其中sep = ","是分隔符改为逗号，quote=F表示字符串不加双引号（默认格式带有双引号） ，而quote函数如果为TRUE的话则表示要带双引号，如果是FALSE，就像这里的quote=F表示不加双引
• 变量的保存与重新加载
  保存的格式是RData。
  save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
  save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
  load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令
• 提取元素
  这里的X是指的我用过的一个变量名，实际应用要懂得替换。刚才让师姐测试我教程的时候很担忧你们粗暴地复制我的代码，最后啥也没看懂。
  X[x,y]#第x行第y列
  X[x,]#第x行
  X[,y]#第y列（横着写）
  X[y] #第y列（竖着写）
  image.png
  X[a:b]#第a列到第b列
  X[c(a,b)]#第a列和第b列
  X$列名#也可以提取列（并且支持Tab自动补全，不过只能提取一列，优秀写法）
• 直接使用数据框中的变量
  比如要取提取列名case和values的为某两列作散点图：
  1. 方法1
  c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50)) 这里的paste是拼接字符串的函数
  plot(c$case,c$values)
  但这里说这里这种方法有个缺点：数据框名a在代码中重复出现（此处试验了下没有）
  2. 方法2（这种方法数据框名a在代码中就不重复出现了）
  with(c,{
+ plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了with循环仍有效。
  })
  什么是with循环? 如下百度感觉很形象
  image.png
  全局变量含义？
  函数内部的变量通常为局部变量，可以通过 <<- 赋值，成为全局变量，这样就可以在其他函数中被调用。

三.其他注意TIP

• 脚本窗口使用
  新建脚本，并在里面打代码/粘贴大神代码。然后保存到RDATA工作目录下，打开,注意脚本文件的后缀就是R
  

  image.png

• 在哪看变量
  引自生信星球
  

  image.png

• 其他潜意识小tip
  来自生信星球的大神总结
  （1）R的赋值符号不是等号，而是<-
  （2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行
  （3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。
  （4）显示工作路径 getwd()
  　　设置工作路径setwd("C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata")
  （5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。
  （6）表格在R语言中改名叫数据框^_
  （7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
  （8）数据类型(两重点)
  向量（vector）,矩阵（Matrix）,数组（Array）,数据框（Data frame）,List

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