R语言绘图（ggplot2、ggpubr）从入门到精通01--课

本系列课程要求大家有一定的R语言基础，对于完全零基础的同学，建议去听一下师兄的《生信必备技巧之——R语言基础教程》。本课程将从最基本的绘图开始讲解，深入浅出的带大家理解和运用强大而灵活的ggplot2包。内容包括如何利用ggplot2绘制散点图、线图、柱状图、添加注解、修改坐标轴和图例等。

本次课程所用的配套书籍是：《R Graphic Cookbooks》

除了以上的基本图形外，师兄还会给大家讲解箱线图、提琴图、热图、火山图、气泡图、桑基图、PCA图等各种常用的生信图形的绘制，还不赶紧加入收藏夹，跟着师兄慢慢学起来吧！

第一章：快速探索数据

1. 散点图：

   • 最简单的函数：plot(x, y)

     plot(mtcars$wt,mtcars$mpg)
     

01.png

• 使用qplot

  library(ggplot2)
  qplot(mtcars$wt,mtcars$mpg)
  
  qplot(wt,mpg,data = mtcars) # 如果变量x和y都来自于同一个数据框，还可以这样写；
  

• 使用ggplot2

  ggplot(mtcars, aes(x=wt, y=mpg)) + geom_point()
  

02.png

2. 折线、曲线图：

   • 同样可以用plot来画：

     # plot中type参数可以指定绘图的类型：如："l"就是指折、曲线图
     plot(pressure$temperature,pressure$pressure,type = "l")
     points(pressure$temperature,pressure$pressure)
     
     lines(pressure$temperature,pressure$pressure/2, col = "red")
     points(pressure$temperature,pressure$pressure/2, col = "red")
     

03.png

• 使用qplot

  library(ggplot2)
  qplot(pressure$temperature,pressure$pressure,geom = "line")
  
  qplot(temperature,pressure,data = pressure, geom = "line") # 如果变量x和y都来自于同一个数据框，还可以这样写；
  

• 使用ggplot2

  ggplot(pressure, aes(x=temperature, y=pressure)) + geom_line() + geom_point()
  

04.png