生信星球Day3

• conda是lunix的应用商店
• miniconda是conda的精华版

下载安装conda

1. 进入清华镜像网站
2. 选择对应的位数（uname -a查看服务器位数）
3. 右键复制下载链接
4. cd biosoft

bash Miniconda3-latest-lunix-x86_64.sh

一路Enter或Yes，然后激活

安装应用商店

source ~/.bashrc
source ~/.bashrc

命令行输入conda，出现满屏信息代表安装成功
5.复制下面的代码，添加镜像

添加镜像

# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

1. conda list（查看服务器所有软件列表）
2. conda search fastqc
3. conda install fastqc -y（-y代表全部yes）也可指定版本，如 conda install fastqc=0.11.7 -y
4. conda remove fastqc （卸载软件）