Tips | 基于物种科学双名列表获取物种进化树（带推测的演化时

Emmm，相关推文前述邀请了朋友写过，不过今天老邱问我能不能优化一下 TBtools 的进化树解析功能时，我还是看了一下，发现，用「TimeTree」网站，基于物种双名获取一棵物种树，真的很简单。
首先，准备一个物种双名列表，比如

Parus_major
Cyanistes_caeruleus
Taeniopygia_guttata
Lonchura_striata
Pseudopodoces_humilis
Corvus_cornix_cornix
Corvus_brachyrhynchos
Pipra_filicauda
Corapipo_altera
Manacus_vitellinus
Neopelma_chrysocephalum
Falco_naumanni
Falco_rusticolus
Picoides_pubescens
Tyto_alba
Aquila_chrysaetos_chrysaetos
Haliaeetus_leucocephalus
Calypte_anna
Coturnix_japonica
Numida_meleagris
Anser_cygnoides
Cygnus_olor
Aythya_fuligula
Nothoprocta_perdicaria

随后，直接打开 TimeTree 网站

http://timetree.org/

浏览页面末端

选择完成后，点击 Upload

随后等待即可

如此，搞定。至于要怎么得到一个简单的进化树文件，逻辑上可以用 EasyCodeML 的小功能。或许后续我可以专门写一个功能来清理进化树。（PS：似乎可以用 TBtools 进行进化树可视化后提取树文本，anyway，清理不清理，逻辑上不影响后续使用）...
我翻了下前面的教程，似乎也包括了，不过用的是 MEGA清理。