学习小组—豹—Day3

资料引用

https://mp.weixin.qq.com/s/6EMXC4n7UEkXphcvfdfBKQ

conda安装

- 添加镜像

添加镜像# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

- 过程

cd ~/biosoft
wget 软件下载网址https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

「for Windows」请记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了，选中，鼠标左键点一下是复制，右键点一下是粘贴；
「for Mac」直接cmd + c 复制，cmd + v粘贴
过程简单，最后一步需注意
source ~/.bashrc来激活conda
命令行输入conda，出现满屏的信息说明成功了
如果报错，说明你可能没有进行上一步的source ~/.bashrc命令。

conda使用

• 查看软件列表
  conda list
• 搜索软件
  conda search fastqc
• 安装软件
  conda install fastqc -y
• 卸载软件
  conda remove fastqc
• 建立新环境
  conda create -n rna-seq python=3
• 查看conda 环境
  conda info --envs
• 激活conda环境，建立新环境后需激活，不同环境切换需要执行该命令
  conda activate 新环境名
• 删除环境
  rm -r 文件路径