课前准备---空转共定位分析python封装版(细胞类型、配受体 2024-07-10 本文已影响0人 单细胞空间交响乐 作者,Evil Genius 空间转录组的共定位分析已经成了空转分析的必修课了。我们需要如下几种的共定位分析 细胞---细胞 细胞---通路 细胞---TF因子 配受体共定位 一个课题或者项目的分析都是环环相扣的。 我们就需要一个脚本来帮我们实现以上分析,拿到如下的可视化结果 以及背后的矩阵信息。 首先我们需要准备好文件,python版本的h5ad文件,注意要做了cell2location。 封装脚本完整版如下