conda安装bioperl模块之后还是不能调用其中的模块

2021-11-11  本文已影响0人  Bioinfor生信云
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我第一次遇到这种情况的时候,在网上查了很多的教程,试过各种方法,以及重新安装相应的模块还是不能解决,在各种折磨之后终于找到了原因。

查看conda安装bioperl后的存储的位置


conda list

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查看miniconda3目录下,可以看到实际上我们已经安装上了Bio::Seq模块

image.png
bioperl模块的位置,不在 perl 的@INC里

把我们查到的模块路径选择一个安装到perl环境变量里面


export PERL5LIB=/home/data/t0202008/miniconda3/pkgs/perl-bioperl-1.6.924-4/lib/perl5/site_perl/5.22.0/:$PERL5LIB

问题就解决啦

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