在jupyter中使用R

1.conda搭建新环境

装R、Python、Jupyter

$ conda create -n R4.0
$ conda activate R4.0
$ conda install r-base=4.0.5
$ conda install python=3.9.7
$ conda install jupyter

2.配置Jupyter

因为之前在conda（base）下安装过juputer，虽然在新环境下，但这次也不用再去配置（我不理解为啥）。
但不用conda再在新环境 install 一个 jupyter的话，后续步骤就会报这种错（ 我不理解为啥x2）。

> library('IRkernel')                                                                                                                                                                                                                                       
> IRkernel::installspec(user = FALSE)                                                                                                                                                                                                                       
Error in IRkernel::installspec(user = FALSE) :                                                                                                                                                                                                              
  jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec --version” exited with code 127.                                                                                                                                                               
In addition: Warning message:                                                                                                                                                                                                                               
In system2("jupyter", c("kernelspec", "--version"), FALSE, FALSE) :                                                                                                                                                                                         
  error in running command 

但是我认为，如果是第一次安装jupyter的话，肯定是需要配置的，此处省去配置的步骤（毕竟也不用配置了）。

3.安装R包

在 R console 中输入

> install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'uuid', 'digest'))

4.安装R包 devtools

$ conda install r-devtools  ##这个包 install.packages没装明白

5.安装 IRkernel 包

先尝试在 R console 中输入

> devtools::install_github('IRkernel/IRkernel') 
Downloading GitHub repo IRkernel/IRkernel@HEAD                                                                                                                                                                                                              
Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet,  :                                                                                                                                                                                 
  cannot open URL 'https://api.github.com/repos/IRkernel/IRkernel/tarball/HEAD'

装不了，换个姿势

> install.packages('IRkernel')

6.使 R 在 Jupyter Notebook 中可以被探测到

在 R console 中输入

## To install system-wide, set user to False in the installspec command
> IRkernel::installspec(user = FALSE)
[Errno 13] Permission denied: '/usr/local/share/jupyter'
Perhaps you want to install with `sudo` or `--user`?
## Ok, Ok, It seems doesn`t  work.

## Using following command to install the kernel for the current user
> IRkernel::installspec()
[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in /home/ayunga/.local/share/jupyter/kernels/ir

至此，安装完成。

7.测试一下是否安装成功

再次打开 jupyter notebook，在右侧新建的下拉选择里面出现 R，就代表安装成功了。

至此，Jupyter Notebook 里已正确添加 R 核。
测试一下

好用的！