ITK 基础(二) — 图像分割 General Thresho

2020-08-11  本文已影响0人  小张Python

General Threshold 介绍

上篇文章介绍了 ITK 中的二值化分割,最终得到的是 二值图像(图像中只有两种像素值),

但有时我们会遇到另外一种需求,只改变某一阈值范围的像素值,其他部分保留;这时二值化分割已经满足不了我们的基本需求了,需要寻求另外一种方法。

本篇教程介绍 ITK 中的 General Threshold ,是二值化的改进版,可以只改变某一范围内的像素值,并且其它范围内像素值得到保留。

原理讲解

General Threshold 中用到了三种分割方式:

第一种,原理图如下,该方法需要设置一个低临界阈值 Lower Threshold,图像中像素值若低于这个值,其值变为 Outsidevalue,否则像素值不变;

该方法中需要设置二个参数,低像素值设定用到的是 ThresholdBelow() 函数;用户指定 Outsidevalue;

First.png

第二种,方法中需要设置一个高临界阈值 Upper Threshold,图像中像素值若高于这个值,像素值将变成 Outsidevalue,否则像素值不变;

该方法中也需要设置二个参数,高阈值设定用到 ThresholdAbove() 函数,用户指定 Outsidevalue;

Second.png

第三种,结合了前两种,该方法需要设置两个阈值临界 Lower Threshold 和 Upper Threshold 两个值,若像素值介于两者之间则不变,否则设为 Outsidevalue;

方法中需要设置三个参数,低阈值设定用到 ThresholdBelow() 函数,高阈值设定用到 ThresholdAbove() 函数,用户指定 Outsidevalue;

Third.png

代码实现

General Threshold 分割方法用到主要头文件为 itk::ThresholdImageFilter ;该 Filter 中阈值的设置用到两个函数:

#include<itkThresholdImageFilter.h>
#include<itkImage.h>
#include<itkImageFileReader.h>
#include<itkImageFileWriter.h>
#include<itkPNGImageIOFactory.h>
#include<string.h>
​
using namespace std;
​
int main()
{
 itk::PNGImageIOFactory::RegisterOneFactory();
 string input_name = "D:/ceshi1/ITK/Filter/General_Seg/input.png";
 string output_name1 = "D:/ceshi1/ITK/Filter/General_Seg/output1.png";
 string output_name2 = "D:/ceshi1/ITK/Filter/General_Seg/output2.png";
 string output_name3 = "D:/ceshi1/ITK/Filter/General_Seg/output3.png";
​
 using PixelType = unsigned char;
 using ImageType = itk::Image<PixelType, 2>;
 using FilterType = itk::ThresholdImageFilter<ImageType>;
 using ReaderType = itk::ImageFileReader<ImageType>;
 using WriterType = itk::ImageFileWriter<ImageType>;

 ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
 WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
 FilterType::Pointer filter = FilterType::New();
​
​
 reader->SetFileName(input_name);
 writer->SetFileName(output_name1);
 writer->SetInput(filter->GetOutput());

 filter->SetInput(reader->GetOutput());

 //first Threshold method;
 filter->SetOutsideValue(0);
 filter->ThresholdBelow(170);
​
 try
 {
 filter->Update();
 writer->Update();
​
 }
 catch (exception & e)
 {
 cout << "Caught Error" << endl;
 cout << e.what() << endl;
 return EXIT_FAILURE;
 }

​
 filter->ThresholdAbove(190);
 writer->SetFileName(output_name2);

 try
 {
 filter->Update();
 writer->Update();
​
 }
 catch (exception & e)
 {
 cout << "Caught Error" << endl;
 cout << e.what() << endl;
 return EXIT_FAILURE;
 }
​

 //Third Threshold Seg;
 filter->ThresholdOutside(170, 190);
 writer->SetFileName(output_name3);

​
 try
 {
 filter->Update();
 writer->Update();
​
 }
 catch (exception & e)
 {
 cout << "Caught Error" << endl;
 cout << e.what() << endl;
 return EXIT_FAILURE;
 }
​
​
 return EXIT_SUCCESS;
​
​

该例子中,用到的输入图像为 ITK 官网提供的大脑切片 PNG 图像,参数设定情况如下:Lower Threshold 设为170,Upper Threshold 设为190,Outsidevalue 设为 0,

最后生成的结果图如下,第 2-4 张图片分别为 第一至第三种方法生成得到的结果。

Snipaste_2020-05-03_17-15-15.png
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