2021-08-04:GO富集网络可视化工具
2021-08-06 本文已影响0人
wangyantao1991
利用Cytoscape上的插件可以实现GO 分析的网络化,不过非模式植物会很麻烦:具体参考了简书的以下内容:
Bingo(Cytoscape插件)GO功能富集分析 - 简书 (jianshu.com)
![](https://img.haomeiwen.com/i25983175/a54895c534715cb4.png)
之前拿到了GOlist,只不过需要删除中间的tab+GO:
使用sed ‘s/\tGO:/ = /g' 进行编辑,这个格式的注释文件需要注意,在注释文件的首行需要添加一段文字:
(species=sss_aa)(type=Consortium)(curator=GO)
![](https://img.haomeiwen.com/i25983175/27c01801ec9738cb.png)
首行加上上述文字后就能被识别了。