确定蛋白浓度（三）|自学生信Python（第二十三天）

确定蛋白浓度（三）

前面两篇文章已经介绍和讲解了问题答案代码的部分含义，下面将进行后续的讲解。（建议结合前面两篇文章阅读）

插入和删除行
在计算 Lowry 的数据时，必须首先去掉标签行。 由于该表存储为一个列表，可以使用所有列表支持的操作。 通过切片操作删去整个第一行，即保留除第一个元素以外所有其他元素 :

table = table[1:]

或者，可以使用 pop()方法:

table.pop(0)

记住，索引从 0 开始。 同样也可以删除任何其他行，如第三行

table.pop(2)

或者用切片 :

table = table[:2] + table[3:]
类似地，还可以使用列表功能在给定的位置插入新行:

table.insert(2, [0.55,0.123,0.122,0.145])

或者可以在末尾添加一个新行:

table.append([0.55,0.123,0.122,0.145])

表的添加和删除用一行代码就可以完成。

访问列

嵌套列表方法的缺点是，访问列不那么简单直接，因为一列的数据分布在所有行中。 当然，可以在表上运行一个循环来收集一列的所有数据:
protein = []
for row in table：
protein.append(row[]）

如果想用这种方法提取多列或访问相同的列多次，程序将变得很长，难以阅读。 在 Python 中可以使用更有效的缩写 :
protein,ext1,ext2,ext3 = zip(table)
zip(table) 命令把每一列转换为单个元组变量，从而有效地将表旋转 90°。 此操作虽然语法很短，但需要用一些时间来才能完成。 因此对于大数据集，用 for（）循环可能会更好。

合并多列

四个列都被存储在单独变量中(含有列表或元组)之后，需要把它们组合成一个两列的 表(见表 7.2) 。

加号(+)和乘法（*）运算符在 Python 中可以分别应用于列表和元组的合并和乘法。 乘法通过复制来扩展列表:

protein = protein* 3

这会导致同样的数据出现三个相连的副本 :

>>> [1,2,3] * 3 
[1, 2,3,1,2,3,1,2,3] 

加法将两个或多个列表或元组连接为一个:

>>> [1,2,3] + [4,5,6] 
[1,2,3,4,5,6] 

其结果是包含所有数据项的一个列表或元组，一个后面跟着另一个:
extinction = ext1+ ext2 + ext3

在前面的程序中，这些行的结果是通过将这三列消光值合并成一个单一的列，蛋白质列中的信息增加到原来的三倍，以包含相应的值。

问答: 如果将包含不同的数据类型的列表组合在一起会怎样? Python 并不关心乘用" 长 "运算符或连接用 " + "操作符所计算列表的内容。 例如可以轻 松地创建首先包含数字之后是字符串的列表。 但是，当要对列表中所有元素使用 for 循环或 类似 sumO这样的函数时，不同的数据类型会导致问题。如果觉得嵌套列表结构不足以达到 目的，可以考虑使用嵌套字典(见例 7. 2)或类。

zip( )函数

内置的 zip()函数和星号究竟如何工作? zip()命令可以将两个或多个列表中的元素一 个接一个地相结合，如

>>> zip( [1,2,3), [4,5,6]) 
[(1,4),(2,5),(3,6)]

其结果是，每个输入列表中的第一个元素配对在一起，然后是第二个元素，以此类推。 zip()函数的参数必须是可迭代的(列表，元组，字符串) 。 它返回的结果是一个包含数个元组的列表，其中第 i 个元组包含来自每个参数的第 i 个元素。 例如，前面文章代码中星号告诉 zip 函数使用嵌套列表中的所有列表作为参数，可以写为

zip (*table)

即，

zip (table [0],table [1],table [2],table [3])

将 zip() 函数的参数看成一张表中的行，zip (*table)符号将表旋转 90° :

>>> data = [[1,2,3],[4,5,6]]
>>> zip (*data) 
[(1,4),(2,5),(3,6)]

总之， zip() 函数像拉链一样将列表中的各项配对，符号将所给的变量解释为每行都是参数组成的一列。zip()的一个很常见的用法是旋转(或转置)表*，这使得访 问表中的列更为轻松。

插入和删除列

zip() 函数可以 90°旋转表 :

table = zip (*table)

有了这一招，就可以像对行一样对列进行访问、插入、删除。 例如，需插入一列就要先转置表，插入一行，最后再将表转置回来 :

table =zip(table)
table.append(['ext4',0,0,0,0,0,0])
table = zip(table)

该代码添加一个额外的第一行带标签的全零列。 如果想从一个表中删除一列，可以使用同样的方法:

table =zip(table)
table.pop(1)
table = zip(table)

以上代码消除了整个第二列，但这种方法有一个小缺点， zip(*table)操作将其中的列表变 为了元组。 正如以前所述，元组是不可变的。 这意味着用了 zip()之后，不能再对单个单元格进行操作。需要将行再次转换为列表:

table [1] = list (table [1])
table [1][2] = 0.123

用这两行指令可更改 zip(*table)后的单个单元格的值。 图 7. 2 总结了可对表使用的 指令。