学习小组Day7笔记-zkh
2020-11-29 本文已影响0人
zZ_f79f
测序
Sanger测序
ddNTP
测序读长长(1000bp),准确
通量低
二代测序 PE(Pair End双端)
边合成变测序(sequence by synthesis, SBS)
- DNA文库构建
- 桥式PCR
- 测序
- 数据产出
高通量,读长短,错误率高
三代测序
- PacBio 实时单分子测序
- 复合探针-锚定连接技术
- 纳米孔单分子通道技术
-
Ion Torrent电子流检测技术
测序.png
1.基因组学(核酸序列分析)
(1)全基因组测序(WGS)
(2)全外显子组测序(WES)
(3)简化基因组测序(RRGS)
①RAD-Seq
②GBS
③2bRAD
④ddGBS(也就是ddRAD)
2.转录组学(基因表达分析)
(1)mRNA-Seq
(2)IncRNA-Seq(长链非编码RNA)
(3)sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)
3.蛋白质组学
(1)蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定
(2)构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用
(3)蛋白质结构功能预测
(4)蛋白质连锁图
4.代谢组学
(1)代谢物指纹分析
(2)代谢轮廓分析
组学.png