Ubuntu R 运行bedr报错 ERROR: missin
2022-07-31 本文已影响0人
煮梦斋_bioinfo
Ubuntu中R调用bedr报错ERROR: missing binary/executable bedtools，发现bedr依赖于bedtools，需要先安装bedtools,然后在R中再安装bedtoolsr
- 从https://github.com/arq5x/bedtools2/releases中下载最新的bedtools的zip文件
- 解压
- 进入文件夹 cd src/bedtools2-2.30.0
sudo make
sudo make install
- 从 https://github.com/PhanstielLab/bedtoolsr中下载最新版本的bedtoolsr的zip文件
- 解压
- 进入R界面
- 本地安装bedtoolsr
install.packages("/path/to/bedtoolsr-2.30.0-2", type="source", repos=NULL)
