生信星球培训第六十四期

Day5-好问

2020-06-09  本文已影响0人  howwin_2dab

R数据类型

1、向量

标量&向量

标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量(一个向量是一排有序排列的元素,以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。)

变量赋值

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

提取元素

分为根据元素位置提取和根据值提取
元素位置
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

2、数据框

读取本地数据

read.table命令
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header = T)
(header=T代表读入数据时将第一行作为列名(若是F则相反,不使用文件中第一行作为列名),也可以写为header=TRUE(或是header=FALSE)
读入txt文件不用指定sep参数,因为read.txt函数默认参数sep='\t'。当然愿意的话你也可以指定,那样的话会显得有点多余)
读入csv文件必须指定sep=','不指定不会报错但是会出现你读入的数据只有一列的情况

设置行名和列名

colnames(x) #查看列名
rownames(x) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(x)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
x<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = ",",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

导出数据框

write.table(x,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)

变量保存与重新加载

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(x,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

提取元素

X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y] #也是第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)

save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?

报错未找到名为X的变量,可能是由于大小写错误导致。

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