Day6-Hector-Installing On Linux

· Miniconda

Miniconda是在Linux上的一个快捷的软件下载器。下面说明Miniconda在Linux环境下的下载与安装：

· Miniconda的下载

搜索“Miniconda 清华”找到Miniconda的清华镜像下载地址，网址为

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/

以x86位的Linux为例（查看Linux的位数，输入命令uname -a），下载地址为：

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
复制该链接，在Linux中使用wget命令进行下载：

mkdir biosoft
cd biosoft
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh

· Miniconda的安装

下载好之后，输入以下命令：

bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh

然后进入安装步骤。一路按照提示，所有要Enter的地方Enter，要yes的地方yes
最后进行激活，输入以下代码：

source ~/.bashrc

出现满屏信息，就说明安装成功了。
然后添加镜像，复制以下代码：

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

· 安装fastqc包

conda search fastqc #搜索conda软件fastqc
conda install fastqc -y #安装fastqc，-y表示安装过程中所有问题回答yes

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