GEO数据快速下载——终于不用去国外数据中下载数据了

使用方法

1.网址：http://sangerbox.com/Information?page=1&chk3=&chk5=&chk1=&chk2=&chk4=&chk6=

2.输入关键字（以肺癌为例）

点击添加图片描述（最多60个字）编辑

3.选择数据：

下载整合之后的数据：样本的临床信息、将探针号转化为GeneSmybol表达矩阵：

点击添加图片描述（最多60个字）编辑

4.选择表达矩阵的下载方式

点击添加图片描述（最多60个字）编辑

5.下载原始数据合GEO数据库中数据一样，下载数据比较超快。

点击添加图片描述（最多60个字）编辑

6.结果目录：将数据下载到个人中心，在将数据下载到本地。

点击添加图片描述（最多60个字）编辑

注：遇到有些GSE号下面会没有数据集时，先将这个GSE号输入到GEO官网上，看看作者有没有上传了这个数据集，如果GEO数据库中显示这个数据的表达矩阵即series_matrix.txt.gz文件大小为几K、几十K、或者几百K，说明该数据集作者没有上传表达谱矩阵。