转化子（transformant ）的筛选与重组子的鉴定

转化子与非转化子：感受态细胞中是否带有质粒？
重组子与非重组子：感受态细胞中是否带有重组质粒？
目的重组子与非目的重组子：重组质粒中的目的基因是否正确？
假阳性转化子：只接受了载体或者接受了不含目的基因的重组子的转化子。

目的重组子的筛选

1. 基于载体遗传标记的筛选与鉴定（表型筛选法）：
载体表型选择法、插入基因的选择法
抗药性筛选法--抗生素
人工构建的基因工程载体，都带有一个或几个可选择的遗传标记基因或决定表型特征的基因，转化后的受体菌可在含有相应抗生素的培养基上正常生长，而不含此载体的DNA的受体菌就不能存活。
2. 基于目的基因序列的筛选与鉴定（核酸水平筛选）：
PCR鉴定法、酶切法、测序法
从转化后的菌体克隆中分离质粒，电泳，比较其分子大小。
3. 基于目的基因表达产物的筛选与鉴定（蛋白质水平筛选法）：
检测酶活性、分子大小
4. 基于报告基因的筛选与鉴定