生信星球培训第六期

学习小组Day7笔记--纸心

2018-09-23  本文已影响3人  纸心_67f1
各代测序

各代测序原理介绍

以下引自美格基因


第一代测序(Sanger测序)
第二代测序 第三代测序

各代测序对比

以下引自生信星球


生信星球

最后是各组学的介绍(引自生信星球)

1.基因组学(核酸序列分析)

(1)全基因组测序(WGS)
(2)全外显子组测序(WES)
(3)简化基因组测序(RRGS)
①RAD-Seq
②GBS
③2bRAD
④ddGBS(也就是ddRAD)
作用:
(1)基因组作图(遗传图谱、物理图谱、转录本图谱)
(2)核苷酸序列分析
(3)基因定位
(4)基因功能分析
其它:
以全基因组测序为目标的结构基因组学
以基因功能鉴定为目标的功能基因组学

2.转录组学(基因表达分析)

(1)mRNA-Seq
(2)IncRNA-Seq(长链非编码RNA)
(3)sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)
作用:
(1)获得物种或者组织的转录本信息
(2)得到转录本上基因的相关信息,如基因结构功能等
(3)发现新的基因
(4)基因结构优化
(5)发现可变剪切
(6)发现基因融合
(7)基因表达差异分析

3.蛋白质组学

(1)蛋白质组数据处理、蛋白及其修饰鉴定
(2)构建蛋白质数据库、相关软件的开发和应用
(3)蛋白质结构功能预测
(4)蛋白质连锁图

4.代谢组学

(1)代谢物指纹分析
(2)代谢轮廓分析

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