如何在linux环境下安装软件——conda

安装和使用Miniconda

安装

1. 进入https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
2. wget 粘贴下载链接
3. source ~/.bashrc #激活conda
4. 配置镜像源
   conda config --add channels
   https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
   conda config --add channels
   https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
   conda config --add channels
   https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
   conda config --set show_channel_urls yes # 上述代码 配置清华镜像

使用conda

1. conda list #查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda search 软件名（e.g.conda search fastqc） #搜索conda软件
2. conda install 软件名 -y #-y是yes，如果要指定版本号，可以conda install fastqc=0.11.7 -y
3. conda remove 软件名 -y #卸载软件

利用conda创建环境

• conda create -n

  
  Day3 conda 安装与使用.png