自写微生物数据分析的R包
2022-05-15 本文已影响0人
生信学习者2
前言
我又重新回到了微生物研究领域了,现在特别想写一个适合自己的微生物数据分析的R包,于是昨天开始写了。
架构
和我先前写的MyRtools包类似的架构,只是内容增加了很多。
暂时实现功能(Vignettes效果图)
PERMANOVA
比如很多人邮件我关于PERMANOVA代码,现在MicrobiomeAnalysis提供了完整的函数,大家直接调用就可以啦。PS: 不过对输入数据的格式有要求.
GitHub仓库
MicrobiomeAnalysis,大家可以到这里https://github.com/HuaZou/MicrobiomeAnalysis/releases 下载已经编译好的包。
进展
Differential Analysis
DA部分已经写完,非常感谢microbiomeMarker,现在所有的DA方法都是直接copy了这个包的,极力推荐该包。
网址
提供了最新的包解释网址 MicrobiomeAnalysis package
Help & feedback
欢迎大家提意见给我,邮件或是GitHub issue都可以。
最后希望我能完成架构里面的所有模块和功能吧。加油加油!!!