Shiny生产环境部署与共享
2018-11-03 本文已影响114人
willnight
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前段时间看到有人在问怎么让自己的shiny程序让别人能够看到,今天来写篇文章总结下!
shinyApp: http://120.78.66.186:3838/test1/
一.在同一局域网内
在同一局域网内的话很简单只要对方能访问到你的ip和shiny端口就行,直接访问就行
- 先看下两台机子的ip
跑shiny服务的主机一般是你自己的机子
macip
访问你应用的主机
windowsip
可以看到在同一网段内的!
- 部署shiny应用
这边的话要自己指定host为0.0.0.0,不然默认是127.0.0.1,那别人是访问不到的
runApp("Downloads/csfz/wenjianshangchuan/test1/app.R",port = 7777,host="0.0.0.0")
- 可以看到在本机127可以访问,而在另一台上也可以,注意这边访问的地址
macshiny
windowsshiny
所以这种方式的话在局域网内是很容易实现的!!
二.在服务器上部署
在服务器上部署的话就很方便共享啦
- 第一种方式是去先在服务器上部署shinyServer,然后把你的shiny工程放入他的默认目录下就可以了。安装过程的话网上随便一搜就有了。
- 第二种方式的话是使用docker,个人比较推荐的,方便快捷拿来就用。
- 安装docker(docker应用还是很广的,装一下准没错)
- 去dockerhub找一下shiny相关的镜像
- 这边简单点直接docker pull 这个镜像,然后docker exec 或 run 进入容器,然后进入R进行install.packages 安装你的shiny应用所需要的包
- 第二种的话比较推荐,还是出于方便部署的原因,去github上把这个镜像的工程目录git下来然后修改Dockerfile
docker pull quantumobject/docker-shiny
docker run -d -p 3838:3838 -v <你的shinyapp路径>:/srv/shiny-server -ti quantumobject/docker-shiny /bin/bash
进去后输入R,然后安装你需要的依赖包就行
第二种方法
git clone https://github.com/QuantumObject/docker-shiny
修改dockerfile,主要是在安装包那边把你的包加上,然后把repos改成清华的,为了速度。(这边是我加了我的demo的包,各位按需加就行)
#name of container: docker-shiny
#version of container: 0.6.1
FROM quantumobject/docker-baseimage:18.04
MAINTAINER willnight "willnight@yeah.net"
# Update the container
# Installation of necessary packages/software for this container...
RUN apt-get update && DEBIAN_FRONTEND=noninteractive apt-get install -y -q r-base \
r-base-dev \
libssl-dev \
libsasl2-dev \
gdebi-core \
libapparmor1 \
sudo \
libssl1.0.0 \
libcurl4-openssl-dev \
&& apt-get clean \
&& rm -rf /tmp/* /var/tmp/* \
&& rm -rf /var/lib/apt/lists/*
RUN R -e "install.packages('shiny', repos='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/')" \
&& update-locale \
&& wget https://download3.rstudio.org/ubuntu-14.04/x86_64/shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb \
&& dpkg -i --force-depends shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb \
&& rm shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb \
&& mkdir -p /srv/shiny-server; sync \
&& mkdir -p /srv/shiny-server/examples; sync \
&& cp -R /usr/local/lib/R/site-library/shiny/examples/* /srv/shiny-server/examples/.
RUN R -e "install.packages('rmarkdown', repos='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/')"
RUN R -e "install.packages(c('devtools','shinydashboard','shinythemes','DT','openssl','formattable','readxl','mongolite','lubridate','glue','openxlsx','shinydashboardPlus','shinyWidgets'), repos='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/')"
RUN R -e "devtools::install_github('nik01010/dashboardthemes')"
##startup scripts
#Pre-config scrip that may be needed to be run one time only when the container run the first time .. using a flag to don't
#run it again ... use for conf for service ... when run the first time ...
RUN mkdir -p /etc/my_init.d
COPY startup.sh /etc/my_init.d/startup.sh
RUN chmod +x /etc/my_init.d/startup.sh
##Adding daemons to containers
RUN mkdir /etc/service/shiny-server /var/log/shiny-server ; sync
COPY shiny-server.sh /etc/service/shiny-server/run
RUN chmod +x /etc/service/shiny-server/run \
&& cp /var/log/cron/config /var/log/shiny-server/ \
&& chown -R shiny /var/log/shiny-server \
&& sed -i '113 a <h2><a href="./examples/">Other examples of Shiny application</a> </h2>' /srv/shiny-server/index.html
#volume for Shiny Apps and static assets. Here is the folder for index.html (link) and sample apps.
VOLUME /srv/shiny-server
# to allow access from outside of the container to the container service
# at the ports to allow access from firewall if accessing from outside the server.
EXPOSE 3838
# Use baseimage-docker's init system.
CMD ["/sbin/my_init"]
- 测试运行
上面的步骤做完运行就很简单了
docker run -d -p 3838:3838 -v /root/Myrpro/:/srv/shiny-server myshiny
效果 http://120.78.66.186:3838/test1/
- 最后如果测试成功后可以通过docker-compose 或者 k8s进行部署。