Linux 生信软件路径设置及进程管理

1、创建 bin 目录，bin 目录默认为可执行文件

mkdir bin
cd bin

2、将主程序 ln -s 链接到目录下，类似于 windows 系统中的发送桌面快捷方式。

ln -s 软件所在位置全路径

3、将 bin 目录添加到 .bashrc PATH 变量中

vi .bashrc
export PATH="$PATH:/opt/blc/bin:<bin路径,即需要复制的内容>:$PATH"

4、刷新 .bashrc

source ./.bashrc

5、查找文件路径

which 文件名 
locate 文件名 #通过安装索引来查找，若软件没有安装好，则不会找到

6、后台运行
程序后台运行,加 & 符号

blat a.fna b.fna &

查看后台运行程序

jobs

程序运行过程中，切换到后台

ctrl z #暂停程序
bg #切换到后台
fg #调出程序

7、查看程序的实时程序

top 
htop