比较与进化基因组

每日paper - 20220408 - 哺乳动物早期分化历史

2022-04-08  本文已影响0人  阿芃

Molecular phylogenetics and the origins of placental mammals

2001 年发表在 Nature 上。第一作者为美国国家癌症研究所基因组多样性实验室的 W J Murphy。

研究者们希望解决哺乳动物早期分化历史的问题。对 64 个有胎盘哺乳动物(真兽亚纲)的 18 个同源基因的变异进行了研究,研究结果将它们分为四个 superordinal clade:Afrotheria(非洲兽总目,包括大象、海牛、蹄兔、马岛猬、土豚、象鼩等)、Xenarthra(贫齿总目,包括树懒、食蚁兽、犰狳等)、Glire(啮齿总目,包括啮齿目和兔形目,是灵长类、狐猴和树鼩的姐妹类群),剩下的目构成第四类(包括鲸类、偶蹄类、奇蹄类、食肉类、穿山甲、蝙蝠和核心食虫动物)。

Figure 1 Phylogenetic relationships among 64 placental mammals and two marsupials based on analysis of 9,779 bp from 15 nuclear and three mtDNA genes.

本研究的结果中,非洲兽总目首先分化出来,贫齿总目随后出现,另外两个大类最后出现。这是非常早期的研究了,并且仅基于少数的位点。随着测序技术的进步,研究手段也有了很大的进步,如今我们对哺乳动物早期分化历史有了不一样的认识。

现在的有胎盘类哺乳动物可以分为四大类:贫齿总目、非洲兽总目、灵长总目、劳亚兽总目。(2021年综述:Phylogenomics and the Genetic Architecture of the Placental Mammal Radiation

Fig 1. Phylogenetic relationships and timescale among placental mammal orders based on a consensus of published studies.
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