gtf文件中如果只有exon,想增加gene和transcrip
2022-06-13 本文已影响0人
小明的数据分析笔记本
![](https://img.haomeiwen.com/i6857799/24a3fc819d2bd14f.png)
我的gtf注释文件如上
我想要的如下
![](https://img.haomeiwen.com/i6857799/97b4e26468b9ac46.png)
参考链接
https://www.biostars.org/p/224372/
使用gffread软件
可以直接使用conda安装
conda install gffread
命令
gffread -E --keep-genes input.gtf -o input/output.gtf
我的gtf注释文件如上
我想要的如下
参考链接
https://www.biostars.org/p/224372/
使用gffread软件
可以直接使用conda安装
conda install gffread
命令
gffread -E --keep-genes input.gtf -o input/output.gtf