2020-11-12 蛋白质的生物合成与调控

• 基因表达是将基因的DNA序列转化为细胞的结构和功能的过程。基因表达是一个多步骤的过程，从组成基因的DNA转录为信使RNA开始。然后是转录后修饰和翻译成基因产物，然后是折叠、翻译后修饰和靶向。细胞表达蛋白质的数量取决于组织、机体的发育阶段和细胞的代谢或生理状态。
• 蛋白质是由一条或多条多肽链组成的生物大分子。
• 氨基酸是组成蛋白质的基本单位，氨基酸通过脱水缩合连成肽链。每一条多肽链有二十至数百个氨基酸残基不等；各种氨基酸残基按一定的顺序排列。蛋白质的氨基酸序列是由对应基因所编码。
• 除了遗传密码所编码的20种基本氨基酸，在蛋白质中，某些氨基酸残基还可以被翻译后修饰而发生化学结构的变化，从而对蛋白质进行激活或调控。
• 多个蛋白质可以一起，往往是通过结合在一起形成稳定的蛋白质复合物，折叠或螺旋构成一定的空间结构，从而发挥某一特定功能。
• 遗传密码（基因编码）信使rna中的三联体密码编码蛋白质中的氨基酸
• 同义密码子编码相同的氨基酸。同义trna具有相同的氨基酸并对相同的密码子作出反应。64个可能的三联体密码子中有20个氨基酸，其余3个密码子为蛋白质合成终止密码子。遗传密码是通用的。
• 20个氨基酸的64个可能的三联体代码中有61个。大多数氨基酸由一种以上密码子表示。
• 同义密码子在遗传密码中具有相同的含义。同义trna具有相同的氨基酸并对相同的密码子作出反应。
• 3个终止密码子(终止密码子、无义密码子):UAG、UAA、UGA。它们导致蛋白质合成终止。
• 氨基酸同义词密码子的数目与蛋白质中同义词密码子的含量呈正相关关系。同义词密码子的某些成员往往比其他成员使用得更频繁，这取决于物种。
• 信使RNA : 翻译的模板
• 基因表达=转录+翻译
• DNA的反义链(模板链)与感觉链（编码链）互补，是合成mRNA的模板链。
• DNA的编码链(感觉链)与mRNA具有相同的序列，并通过遗传密码与其所代表的蛋白质序列相关联。
• 密码子-反密码子识别涉及抖动
• 碱基配对的抖动允许g-u对在密码子的第三个碱基和反密码子的第一个碱基之间形成。
• 转运RNA (tRNA):携带氨基酸
  tRNA序列为74-95 nt。
• 互补碱基配对形成四种茎环结构，折叠成具有四个恒定臂的三叶草二级结构。

• tRNA电荷在受体臂末端形成氨基酰-tRNA。
  反密码子的序列单独决定了氨基酰- trna的特异性
  每个tRNA都能与特定氨基酸相连接。

  
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  反密码子决定了trna的特异性

• 反密码子-密码子相互作用的特异性是由反密码子决定的，而不是由氨基酸所组成的
• 氨基酰tRNA的形成是由一种特殊的酶催化的，即氨基酰tRNA合成酶，它可以特异性地识别tRNA。有(至少)20个氨基酰- trna合成酶。
• 识别元件(paracondon): tRNA中不同的碱基/碱基对，决定了氨酰-tRNA合成酶和tRNA之间的识别
• paracondon: 副密码子。tRNA上除密码子外，还有一些具有密码功能的序列，称之为副密码子
  氨基酰-tRNA(也称aa-tRNA或带电tRNA)是与其同源氨基酸发生化学键合(带电)的tRNA。
• 还有aa-tRNA一些延伸因子，将氨基酸运送到核糖体中供合并多肽链。一个特定的同源氨基酸被带电荷或由氨酰-tRNA合成酶与每个tRNA氨基酰化。这种匹配确保只有特定的氨基酸与tRNA的反密码子相匹配，反过来与信使rna的密码子相匹配，用于蛋白质合成。

整理的太少了，明天要把分子生物和基因组学的后半部分整理掉，然后学一点R，晚上把要背的材料打印出来