一篇小麦基因家族研究的文章

昨天nature上出了一篇关于小麦三代测序那篇文章的新闻报道，报道的题目是“Small group scoops international effort to sequence huge wheat genome”。这是链接地址：http://www.nature.com/news/small-group-scoops-international-effort-to-sequence-huge-wheat-genome-1.22924。

看完第一段我就不淡定了，还真能吹。特别是在IWGSC存在的情况下，其在广大科研人员中实际起到的影响力非常有限，我认为最大的贡献就是这个三代测序的原始数据将来会用于完善IWGSC1.0。当然如果非要和2014年的版本比的话，我也只能呵呵了。这个版本的问题很大，包括其号称的15.34Gb的数据量，实际上包括不少重复存在的片段。下面摘抄第一段

The wheat genome is finally complete. A giant international consortium of academics and companies has been trying to finish the challenging DNA sequence for more than a decade, but in the end, it was a small US-led team that scooped the prize. Researchers hope that the genome of bread wheat (Triticum aestivum) — described in the journal GigaScience this month— will aid efforts to study and improve a staple crop on which around 2 billion people rely.

目前来看，小麦基因组的完善仍然有很长的路要走。下面我们言归正传，今天介绍一篇小麦基因家族研究的文章，文章题目是“Genome-wide analysis of wheat calciumATPases and potential role of selected ACAs and ECAs in calcium stress”，发表在BMC Plant Biology上，作者是一帮老外就不列举了，见下面的摘要部分。基因家族的文章看过很多，套路都差不多，无非是鉴定，接着进化树，各种表达，好的拿个基因组转拟南芥看看。这一篇文章分子实验上非常少，甚至连电子表达分析都没有，更别提组织表达分析了，只有一个钙离子处理前后的差异表达分析，比较出彩的地方是有表型的数据和图片，我想这也可能是这篇文章能发在BMC Plant Biology的原因之一吧，你们怎么看呢?。

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