Python优雅地可视化数据
最近看《机器学习系统设计》。学到了一些用Matplotlib进行数据可视化的方法。在这里整理一下。
声明:由于本文的代码大部分是参考书中的例子,所以不提供完整代码,只提供示例片段,也就是只能看出某一部分用法,感兴趣的需要在自己的数据上学习测试。
最开始,当然还是要导入我们需要的包:
# -*- coding=utf-8 -*-
from matplotlib import pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_iris
import numpy as np
import itertools
1. 画散点图
画散点图用plt.scatter(x,y)
。画连续曲线在下一个例子中可以看到,用到了plt.plot(x,y)
。
plt.xticks(loc,label)
可以自定义x轴刻度的显示,第一个参数表示的是第二个参数label显示的位置loc。
plt.autoscale(tight=True)
可以自动调整图像显示的最佳化比例 。
plt.scatter(x,y)
plt.title("Web traffic")
plt.xlabel("Time")
plt.ylabel("Hits/hour")
plt.xticks([w*7*24 for w in range(10)],['week %i' %w for w in range(10)])
plt.autoscale(tight=True)
plt.grid()
##plt.show()
画出散点图如下:
散点图项式拟合并画出拟合曲线
## 多项式拟合
fp2 = np.polyfit(x,y,3)
f2 = np.poly1d(fp2)
fx = np.linspace(0,x[-1],1000)
plt.plot(fx,f2(fx),linewidth=4,color='g')
## f2.order: 函数的阶数
plt.legend(["d=%i" % f2.order],loc="upper right")
plt.show()
效果图:
曲线拟合3. 画多个子图
这里用到的是sklearn的iris_dataset(鸢尾花数据集)。
此数据集包含四列,分别是鸢尾花的四个特征:
- sepal length (cm)——花萼长度
- sepal width (cm)——花萼宽度
- petal length (cm)——花瓣长度
- petal width (cm)——花瓣宽度
这里首先对数据进行一定的处理,主要就是对特征名称进行两两排列组合,然后任两个特征一个一个做x轴另一个做y轴进行画图。
# -*- coding=utf-8 -*-
from matplotlib import pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_iris
import numpy as np
import itertools
data = load_iris()
#print(data.data)
#print(data.feature_names)
#print(data.target)
features = data['data']
feature_names = data['feature_names']
target = data['target']
labels = data['target_names'][data['target']]
print(data.data)
print(data.feature_names)
这里有一个排列组合参考代码,最后是取出了两两组合的情况。
排列组合的结果是feature_names_2包含了排列组合的所有情况,它的每一个元素包含了一个排列组合的所有情况,比如第一个元素包含了所有单个元素排列组合的情况,第二个元素包含了所有的两两组合的情况......所以这里取出了第二个元素,也就是所有的两两组合的情况
feature_names_2 = []
#排列组合
for i in range(1,len(feature_names)+1):
iter = itertools.combinations(feature_names,i)
feature_names_2.append(list(iter))
print(len(feature_names_2[1]))
for i in feature_names_2[1]:
print(i)
下面是在for循环里画多个子图的方法。对我来说,这里需要学习的有不少。比如
-
for i,k in enumerate(feature_names_2[1]):
这一句老是记不住。 - 比如从列表中取出某元素所在的索引的方法:
index1 = feature_names.index(k[0])
,也即index = list.index(element)
的形式。 - 比如for循环中画子图的方法:
plt.subplot(2,3,1+i)
- 比如for循环的下面这用法:
for t,marker,c in zip(range(3),">ox","rgb"):
plt.figure(1)
for i,k in enumerate(feature_names_2[1]):
index1 = feature_names.index(k[0])
index2 = feature_names.index(k[1])
plt.subplot(2,3,1+i)
for t,marker,c in zip(range(3),">ox","rgb"):
plt.scatter(features[target==t,index1],features[target==t,index2],marker=marker,c=c)
plt.xlabel(k[0])
plt.ylabel(k[1])
plt.xticks([])
plt.yticks([])
plt.autoscale()
plt.tight_layout()
plt.show()
这里的可视化效果如下:
多个子图4. 画水平线和垂直线
比如在上面最后一幅图中,找到了一种方法可以把三种鸢尾花分出来,这是我们需要画出模型(一条直线)。这个时候怎么画呢?
下面需要注意的就是plt.vlines(x,y_min,y_max)
和plt.hlines(y,x_min,x_max)
的用法。
plt.figure(2)
for t,marker,c in zip(range(3),">ox","rgb"):
plt.scatter(features[target==t,3],features[target==t,2],marker=marker,c=c)
plt.xlabel(feature_names[3])
plt.ylabel(feature_names[2])
# plt.xticks([])
# plt.yticks([])
plt.autoscale()
plt.vlines(1.6, 0, 8, colors = "c",linewidth=4,linestyles = "dashed")
plt.hlines(2.5, 0, 2.5, colors = "y",linewidth=4,linestyles = "dashed")
plt.show()
此时可视化效果如下:
竖直线和水平线5. 动态画图
plt.ion()
打开交互模式。plt.show()
不再阻塞程序运行。
注意plt.axis()
的用法。
plt.axis([0, 100, 0, 1])
plt.ion()
for i in range(100):
y = np.random.random()
plt.autoscale()
plt.scatter(i, y)
plt.pause(0.01)
可视化效果:
动态画图