学习小组Day3笔记--pengfang
2020-10-18 本文已影响0人
八段锦1134
生信学习的app store：anaconda>miniconda＞conda
| 命令 | 作用 |
|---|---|
| conda | 看conda提供的一些基本信息 |
| conda list | 安装了哪些软件 |
| conda config --get channels | 查看channels |
| conda config --remove channels | 移除某个channels |
| conda config --add channels | 增加某个channels |
| conda install softwarename(=version) (-y) | 用conda安装某软件,y表示安装过程中有回答yesno问题时都回答yes |
| conda update softwarename | 用conda更新某软件 |
| conda remove softwarename | 用conda卸载某软件 |
| uname -a | 查看服务器是多少位 |
清华源：
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
中科大源:
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --set show_channel_urls yes
难点----conda环境设置（不太懂，还要继续琢磨）
Python 项目一定要隔离环境!
| command | function |
|---|---|
| conda info --e | 查看当前有哪些环境 |
| conda env list | 查看当前有哪些环境 |
| conda create -n your_env_name python=x | 创建python版本为x，名字为your_env_name的虚拟环境。 |
| conda activate 环境名 | 激活某个环境 |
| conda deactivate | 退出环境 |
知识点：安装conda之后，系统前面出现“（base）”
这个base有和没有都是一样，新版本的anaconda才会出现这个base，老版本的不会。这个东西就是起到一个提示作用，因为base环境是默认的，不指定环境其实就是base环境，不过没有经过严格检测，但是理论上是没有问题的。
