SeuratData::测试数据下载地址
2023-03-15 本文已影响0人
倪桦
数据下载链接
http://seurat.nygenome.org/src/contrib/pbmc3k.SeuratData_3.1.4.tar.gz
pbmcsca-http://seurat.nygenome.org/src/contrib/pbmcsca.SeuratData_3.0.0.tar.gz
panc8-https://seurat.nygenome.org/src/contrib/panc8.SeuratData_3.0.0.tar.gz
ifnb-https://seurat.nygenome.org/src/contrib/ifnb.SeuratData_3.0.0.tar.gz
下载后解压缩包 tar xvf *.tar.gz
将包内的 rda 文件放到R语言的库目录下 /<u_Path>/R/library/SeuratData/data ，该目录地址可以在R里面通过 .libPaths() 获得。
载入测试对象
library(Seurat);library(SeuratData)
data("pbmcsca");
seu_use <- pbmcsca %>% SCTransform() %>% RunPCA(verbose = F)
