R语言: as.dist()

2023-10-29  本文已影响0人  LET149

作用: 将数据框转换成 dist(距离) 这种数据格式;这种数据格式会在绘制 进化树 时使用

可能需要此函数配合的包:ape

将数据框转换成 dist 时的实际操作:取数据框的 下三角

1. 使用示例一

> kk <- read.table("/home/zhiyong/Desktop/ZZZZZZZZZZZ/kk.txt")
> kk
   aa bb cc dd
aa  1  2  3  4
bb  5  6  7  8
cc  9 10 11 12
dd 13 14 15 16
> class(kk)
[1] "data.frame"
> 
> pp <- as.dist(kk)
> pp
   aa bb cc
bb  5      
cc  9 10   
dd 13 14 15
> class(pp)
[1] "dist"
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