R语言: as.dist()
2023-10-29 本文已影响0人
LET149
作用: 将数据框转换成
dist(距离)
这种数据格式;这种数据格式会在绘制 进化树 时使用
可能需要此函数配合的包:
ape
将数据框转换成
dist
时的实际操作:取数据框的 下三角
1. 使用示例一
> kk <- read.table("/home/zhiyong/Desktop/ZZZZZZZZZZZ/kk.txt")
> kk
aa bb cc dd
aa 1 2 3 4
bb 5 6 7 8
cc 9 10 11 12
dd 13 14 15 16
> class(kk)
[1] "data.frame"
>
> pp <- as.dist(kk)
> pp
aa bb cc
bb 5
cc 9 10
dd 13 14 15
> class(pp)
[1] "dist"