conda安装生物信息分析软件

首先为什么要写这篇文档，最近看到某公众号一篇教大家如何通过conda配置生信分析软件的付费文档都能大放异彩，受此启发想着也可以写一写，作为一个安装生信软件一直很顺利的人也有颇多的体会，废话不多说直接开干！！！

安装conda

通过清华镜像源下载

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh

bash Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh

一路回车，yes不要做任何更改

vim .condarc 添加conda镜像站点

channels:
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
- bioconda
- defaults
- r
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
- conda-forge
show_channel_urls: true

注：此处带清华网址的为清华镜像源,其余则为官方源，若一直安装软件不成功请删除清华镜像源
至此已经完成了conda安装及配置小伙伴们就可以轻轻松松的安装分析软件了

敲重点(这也许是写这篇文档的意义所在)

曾经有小伙伴询问过，为啥conda安装软件总是一直在转圈，这也许是大部分文档都不会揭示关键点，今天一一在此说明，喜欢的小伙关注个人公众号R语言数据分析指南具体请参考文末链接

conda基础使用方法

conda install -c bioconda bwa  #安装软件

conda create -n xxxx python=2.7 #创建python 2.7 的xxxx虚拟环境
conda create -n xxxx  # 创建xxx环境
conda activate xxx  #激活xxx环境
conda deactivate  #关闭当前环境
conda info --envs　#看所处的环境

conda clean -p     # 删除没有用的包
conda clean -t      # 删除tar包
conda clean -y --all  #删除所有的安装包

参考:https://yuhenabc.com/2018/12/29/proxy/
https://blog.csdn.net/li740207611/article/details/52045471?depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task&utm_source=distribute.pc_relevant.none-task