如何查找感兴趣基因的信息
2022-07-17 本文已影响0人
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数据库链接:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/bfda355eee7710df.png)
数据库的使用方法很简单,我们只需在搜索框中输入基因相关的关键词,比如基因名(symbol),我这里输入BRCA1基因,然后点击Search按钮,得到的结果如下。
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/3b331cdb86e9306b.png)
在Search results中,我们得到了24578个条目(Items),点击第1个条目中得基因名,就可以查看在目标物种该基因相关的信息,如下。
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/16bd13650dd0b5bb.png)
在Genomic context选项中,我们可以查看该基因在染色体中的位置信息,如下。如果想查看详细信息,我们可以通过 Genome Data Viewer来查看结果。
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/4f8db7f4bdd2a517.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/e322adea62156ef0.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/3c93860d14910006.png)
此外,在Expression版块中,我们可以查看BRCA1基因在不同组织中的表达(RNA-seq数据)情况。
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/a73e161f12d8c541.png)
在Bibliography(参考目录)版块,我们可以查看BRCA1基因相关的参考文献。
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/a76b47917a94636d.png)
如果想下载BRCA1基因相关的序列,我们可以点击Download Datasets按钮,分别下载基因、转录本、蛋白的序列文件(FASTA格式)。
![](https://img.haomeiwen.com/i27423876/d2c129420a6fe1f1.png)