测序知识

• 区分一二三代
• 二代流程
• NGS组学

测序过程和原理

• illunima
  https://www.jianshu.com/p/101c14c3a1d2

一代sanger sequencing

sanger sequencing.png

• 测序读长可达1000bp，准确性高达99.999%
• 聚合酶活性下降，一次只测一条，通量低

二代测序

• Roche：454技术
• illumina：Solexa/Hiseq
• ABI：SOLID技术

illunima Hiseq 测序原理
PE (Pair End)

• flowcell： 测序反应的载体/容器，1个flowcell有8个lane

  
  flow cell.png
• lane： 测序反应的平行泳道，试剂添加、洗脱等过程的发生位置
• tile： 每次荧光扫描的位置，肉眼是看不到的
• 双端测序： 可能序列比较长有四五百bp，两边各测120-150bp
• junction： 双端测序中间一些没有测到的区域
• flowcell构造：一个lane包含两列（swath），每一列有60个tile，每个tile会种下不同的cluster，每个tile在一次循环中会拍照4次（每个碱基一次）

-sequence by synthesis SBS
原理介绍视频：https://share.weiyun.com/5qojuBY 密码： 密码：bxsry4

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测序知识

学习小组Day7思维导图-一二三代测序.png

day7学习未完待续