GSEA
2019-08-01 本文已影响0人
MissL_78e0
参考文章:GSEA的分析汇总 - 简书;https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/78561937;GSEA-基因集富集分析 - 小xuo生 - 博客园
输入数据准备参考Data formats - GeneSetEnrichmentAnalysisWiki
Expression Data Formats
使用最后一种TXT: Text file format for expression dataset (*.txt)格式(第一种试了好几次会报错,不知道为啥),excel制作,保存时存成tab-delimited text即制表符分隔文本文件
Phenotype data 用TeXStudio编写,保存为cls格式,其中第二行三种类型顺序与第三行各类型出现的顺序一致,这样不会报错(若按#I II II,load时会报错,不知道为啥)